一個十歲小女孩的故事。一個神秘的故事。
千尋和爸爸媽媽一家子正在搬往城外效區市鎮的途中，爸爸開車拐錯了彎，駛進一條上山的小路。路的盡頭是一座非常奇怪的城門。門口佇立著一座神像。千尋的爸爸媽媽以為是結業了的主題公園，好奇心驅使他們走進了城門隧道。
過了城門見到的彷彿是一個被遺棄的村莊，千尋覺得混身不自在，在後面喊著想阻止爸媽，又害怕失散了只好再跟著走。陣陣的香味把爸媽弔進村子，找到一間美食琳琅的食店，不管店裡沒有人，坐下就只管吃，再也沒有心情理會千尋了。夜幕漸漸低沉，燈火漸明，一幢幢黑影開始出現，嚇得千尋拔腿就跑，想盡快找到爸媽，但當他找到時，發現他們已變成了…
原來這個「神秘之城」是個凡人不可及的地方，誤闖的人只有死路一條，除非…