故事发生在《星际大战：战争危机》后，此时银河正处于一片混乱和动荡之中。约翰•克利顿和未婚妻伊伦•桑几经磨难，逃脱了释嘉伦人的追捕来到水星，却被当地人误认为是入侵者而被晶化。但在还原后，他们惊奇的发现该行星上的居民竟然是远古时期维持银河系和平的一个特殊种族，他们曾经拥有强大的心灵力量。克利顿决定帮助他们恢复力量，重建和平。在寻找失落的心灵力量途中，两大星际势力仍对他们紧追不放，他们的生命岌岌可危。无奈之下，克利顿展示了虫洞能快速吞噬一切的可怕后果……